纯种和杂交怎么看?
首先需要明确一个概念,纯种的定义到底是如何的,这个界定并没有统一的标准(毕竟生物界不存在纯合基因型),不同的学科对纯种的定义是不一样的。以人类为例,人类基因组计划中,人类基因组序列的30亿个碱基对全部完成之后,目前公认的纯合基因型的定义是人类基因组序列没有任何两个位点存在差异的个体 (Haplotype),但人类是一个始终在遗传变异的物种(人类是持续进化着的),这一瞬间的纯合基因型不能代表一个永不过期的标准。
后来人们又建立了另一个概念——全基因组近交系(Genetic Origin Population,简称GOP),用于区分不同来源的相同表型的个体。这种基于群体的纯合基因型不是基于单个个体的,因此能够更好地反映群体水平上的遗传变异情况。判断一个人是否属于某GOP可以根据他/她是否拥有该人群80%以上的基因型来确定。但是,对于杂交品种而言,判断其父本/母本是毫无意义的,因为杂种后代的基因型已经融入了两个亲本的基因型。
另外,最近有学者提出了全新概念——遗传多态性型(genetic polymorphism type,简称GPT) 来替代传统意义上纯种的概念。什么是遗传多态性型呢?简单来说就是以遗传变异为基准确定的一种分类方式。根据已有的实验数据,哺乳动物存在数量巨大的遗传变异,这些遗传变异可以通过SNP、InDel等检测技术进行定量。每个个体都可以用一组特定的数值表示其在群体中的位置,而不用考虑基因型。这样,不同个体之间的差异可以用数值比较的方式表达,而无需关注于基因型本身。
总之,现在科研界主流仍是以遗传多态性型作为衡量标准。那么,如何判断一个个体属于哪一种形态呢?这涉及到一个问题,即如何找到对照组。为了确定某个个体是否是遗传多态性型,需找到与该个体在群体中遗传相似度最高的另一样本,这两个样本的遗传多态性型就是相同的。